So, nachdem ich heute wieder mal mehr Zeit kopfüber im Beifahrerfußraum verbracht habe, als manch amerikanischer Teenager in seinem ganzen Leben, hier der neueste Stand. Seilzug habe ich eingebaut und Deckel wieder manuell verschlossen.
Habe jetzt den Trick gefunden, wie man die hektisch blinkende LED aus bekommt (Reset): Motor an, Dach entriegeln und anheben, aussteigen und auf der Beifahrerseite am oberen Holm den Auflagekontakt (darunter ist ein Schalter) ca. 5 Sek. lang drücken. LED blinkt nicht mehr, brennt aber, weil Dach offen. Dach zu und verriegeln. Ende.
Jetzt weiß die Steuereinheit offensichtlich wieder wo ihr Dach sich befindet. Also Originalzustand wieder hergestellt.
Dann bin ich wieder an den Einbau des Kombimoduls gegangen.
Das Ding ist kaputt!!! Da bin ich ganz sicher. Die Verdrahtung ist garantiert OK. Sobald ich das Ding angeschlossen habe und das Dach anhebe, gehen die Scheiben runter und das wars dann. Ende.
Kein Piepen, Nix. Werde das zurück schicken und um Überprüfung bitten.
Trotzdem viel gelernt. 
LG
Veit