Hallo Benne,
der Verdeckschalter arbeitet als Spannungsteiler, damit sparte sich DC seinerzeit eine Leitung. Wenn die Bordspannung zu niedrig ist, kann sowohl das nachgerüstete Dachmodul als auch die Verdecksteuerung ggf. kein definiertes Steuersignal generieren bzw. auswerten, da die Signalpegel außerhalb ihrer Spezifikation liegen.
Deshalb erst mal die Batterie ordentlich über Nacht laden. Das Verdeck beim Austesten nur bei laufendem Motor öffnen und schließen, die Hydraulik zieht ordentlich Strom aus dem Bordnetz.
Und jetzt noch ein "Geheimtipp"; das Dachmodul wird von einem µProzessor (Typ habe ich im Moment nicht parat, tut aber auch nichts zur Sache) "befeuert"; das Teil hat auch eine Watchdog-Funktion, trotzdem ist es hilfreich, wenn man weiß, dass ein Doppeltipp auf "Schließen" einen Reset veranlasst.
Auch wichtig ist zu beachten, dass nach dem Öffnen des Verdecks das Dachmodul für wenige Sekunden keinen Schließbefehl annimmt, intern läuft noch der Fensterschließbefehl.
Viel Erfolg 